Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms