Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5K2

Usp33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, mousemouse

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Length 909 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp33Q8R5K2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp33Q8R5K2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp33Q8R5K2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp33Q8R5K2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp33Q8R5K2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp33Q8R5K2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp33Q8R5K2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp33Q8R5K2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp33Q8R5K2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp33Q8R5K2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp33Q8R5K2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp33Q8R5K2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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