Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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