Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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