Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Abcf3Q8K268 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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