Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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