Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Lrit1Q8K099 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Lrit1Q8K099 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit1Q8K099 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms