Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms