Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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LgsnQ8CIX8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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