Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms