Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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