Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms