Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx30Q8CE50 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx30Q8CE50 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms