Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtpaQ8BWP5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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