Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms