Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms