Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem87bQ8BKU8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms