Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms