Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms