Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc1Q80VQ1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc1Q80VQ1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms