Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PhkbQ7TSH2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PhkbQ7TSH2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms