Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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