Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms