Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms