Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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