Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms