Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms