Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms