Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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