Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms