Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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