Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms