Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cd47Q61735 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd47Q61735 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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