Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms