Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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