Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms