Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms