Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms