Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms