Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Syne3Q4FZC9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Syne3Q4FZC9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Syne3Q4FZC9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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