Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms