Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms