Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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