Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm29609Q3UU56 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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