Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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