Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms