Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms