Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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