Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms