Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms